ExamDiff Pro的插件系统支持多种文件类型的比较，包括：Word文档、Excel表格、PDF文档、ZIP压缩包、以及通过FTP插件比较远程服务器上的文件。插件在比较过程中将特殊格式的文件转换为可比较的文本格式，然后在ExamDiff Pro中展示差异。ExamDiff Pro 17新增了Word、Excel和PowerPoint比较功能，能够保留表格、列表和注释。插件配置通常位于选项对话框的插件页面。