ExamDiff Pro的目录比较功能允许用户比较两个文件夹的内容差异。使用方法：第一，在Compare对话框中选择Directories选项；第二，指定两个要比较的目录路径；第三，点击Compare执行比较。比较结果显示为目录视图，相同的文件同步显示，不同的文件用颜色标记为新增、删除、更改，以及基于时间戳的更新和更旧。ExamDiff Pro还支持创建目录快照用于后续比较和归档，支持本地文件夹与FTP服务器比较。目录比较是Pro版专有功能，免费版不支持。